А какой Ph у воды которая заливалась из-под крана?
У меня вода скорее щелочная (Ph 7,6- 8,0), так роталы погибают отгнивая от корня. Остальные растения растут нормально. А пузыри без запаха у меня выделяются из грунта где-то 1,5-3 месяца после запуска, в зависимости от толщины слоя грунта. Если сделать толстый слой мелкого грунта над землей - то и больше будет пузырять.
Я бы не стал говорить о закисании грунта основываясь только на факте пузырей из грунта. При закисании грунта должны сгнить корни у почти всех растений.
То, что описал Константин, больше похоже на мою ситуацию.
У меня растет только ротала индика (которая бывшая амания бонсай), и то только в аквариуме с подачей углекислоты. Роталы вообще не любят щелочную воду, да и к нейтральной относятся не очень хорошо.